Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gabpb1Q00420 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms