Protein–RNA interactions for Protein: Q00417

Tcf7, Transcription factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf7Q00417 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcf7Q00417 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcf7Q00417 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tcf7Q00417 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tcf7Q00417 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tcf7Q00417 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcf7Q00417 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms