Protein–RNA interactions for Protein: Q00286

Pou1f1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou1f1Q00286 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pou1f1Q00286 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms