Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PgrQ00175 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PgrQ00175 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PgrQ00175 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PgrQ00175 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PgrQ00175 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PgrQ00175 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PgrQ00175 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PgrQ00175 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PgrQ00175 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PgrQ00175 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms