Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cds1P98191 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cds1P98191 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cds1P98191 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cds1P98191 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cds1P98191 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cds1P98191 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cds1P98191 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cds1P98191 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cds1P98191 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cds1P98191 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms