Protein–RNA interactions for Protein: P97868

Rbbp6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp6P97868 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms