Protein–RNA interactions for Protein: P97471

Smad4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad4P97471 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad4P97471 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad4P97471 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad4P97471 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad4P97471 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad4P97471 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad4P97471 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad4P97471 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad4P97471 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad4P97471 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad4P97471 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad4P97471 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad4P97471 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad4P97471 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad4P97471 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad4P97471 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad4P97471 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad4P97471 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad4P97471 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad4P97471 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad4P97471 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad4P97471 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad4P97471 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad4P97471 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad4P97471 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad4P97471 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad4P97471 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad4P97471 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad4P97471 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad4P97471 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad4P97471 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad4P97471 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad4P97471 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad4P97471 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad4P97471 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad4P97471 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad4P97471 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad4P97471 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad4P97471 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad4P97471 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad4P97471 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad4P97471 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad4P97471 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad4P97471 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad4P97471 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad4P97471 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms