Protein–RNA interactions for Protein: P97376

Frg1, Protein FRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg1P97376 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Frg1P97376 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Frg1P97376 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Frg1P97376 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Frg1P97376 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Frg1P97376 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Frg1P97376 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Frg1P97376 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Frg1P97376 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Frg1P97376 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Frg1P97376 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Frg1P97376 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Frg1P97376 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Frg1P97376 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Frg1P97376 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Frg1P97376 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Frg1P97376 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Frg1P97376 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Frg1P97376 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Frg1P97376 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Frg1P97376 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Frg1P97376 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Frg1P97376 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Frg1P97376 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Frg1P97376 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Frg1P97376 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Frg1P97376 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Frg1P97376 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Frg1P97376 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Frg1P97376 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Frg1P97376 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Frg1P97376 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Frg1P97376 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Frg1P97376 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Frg1P97376 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Frg1P97376 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Frg1P97376 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Frg1P97376 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Frg1P97376 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Frg1P97376 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms