Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhodP97348 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhodP97348 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhodP97348 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhodP97348 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhodP97348 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhodP97348 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhodP97348 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhodP97348 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhodP97348 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhodP97348 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhodP97348 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhodP97348 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhodP97348 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhodP97348 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhodP97348 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhodP97348 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhodP97348 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhodP97348 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RhodP97348 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhodP97348 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhodP97348 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhodP97348 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhodP97348 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhodP97348 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhodP97348 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhodP97348 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhodP97348 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhodP97348 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhodP97348 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhodP97348 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RhodP97348 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhodP97348 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhodP97348 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhodP97348 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RhodP97348 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhodP97348 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhodP97348 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhodP97348 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RhodP97348 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhodP97348 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhodP97348 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhodP97348 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhodP97348 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhodP97348 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhodP97348 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhodP97348 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhodP97348 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhodP97348 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhodP97348 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhodP97348 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhodP97348 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhodP97348 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhodP97348 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhodP97348 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhodP97348 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhodP97348 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhodP97348 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhodP97348 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhodP97348 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhodP97348 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhodP97348 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhodP97348 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhodP97348 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhodP97348 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhodP97348 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhodP97348 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhodP97348 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhodP97348 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhodP97348 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhodP97348 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhodP97348 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhodP97348 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhodP97348 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhodP97348 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhodP97348 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhodP97348 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhodP97348 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhodP97348 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhodP97348 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhodP97348 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RhodP97348 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhodP97348 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhodP97348 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhodP97348 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhodP97348 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhodP97348 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhodP97348 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhodP97348 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhodP97348 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhodP97348 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhodP97348 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhodP97348 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhodP97348 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhodP97348 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhodP97348 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhodP97348 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhodP97348 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RhodP97348 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhodP97348 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms