Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nkx2-3P97334 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nkx2-3P97334 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nkx2-3P97334 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Nkx2-3P97334 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Nkx2-3P97334 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nkx2-3P97334 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nkx2-3P97334 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nkx2-3P97334 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nkx2-3P97334 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nkx2-3P97334 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nkx2-3P97334 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nkx2-3P97334 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nkx2-3P97334 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nkx2-3P97334 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nkx2-3P97334 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nkx2-3P97334 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nkx2-3P97334 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nkx2-3P97334 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nkx2-3P97334 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nkx2-3P97334 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nkx2-3P97334 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nkx2-3P97334 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nkx2-3P97334 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nkx2-3P97334 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nkx2-3P97334 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkx2-3P97334 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms