Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim43bP86448 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim43bP86448 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim43bP86448 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim43bP86448 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim43bP86448 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim43bP86448 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim43bP86448 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim43bP86448 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim43bP86448 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim43bP86448 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim43bP86448 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim43bP86448 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim43bP86448 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim43bP86448 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim43bP86448 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim43bP86448 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim43bP86448 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim43bP86448 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim43bP86448 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim43bP86448 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim43bP86448 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim43bP86448 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim43bP86448 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim43bP86448 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim43bP86448 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim43bP86448 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms