Protein–RNA interactions for Protein: P81270

Erg, Transcriptional regulator ERG, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErgP81270 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ErgP81270 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ErgP81270 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ErgP81270 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ErgP81270 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ErgP81270 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ErgP81270 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ErgP81270 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ErgP81270 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ErgP81270 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ErgP81270 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ErgP81270 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ErgP81270 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ErgP81270 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ErgP81270 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ErgP81270 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ErgP81270 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ErgP81270 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ErgP81270 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ErgP81270 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ErgP81270 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ErgP81270 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ErgP81270 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ErgP81270 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ErgP81270 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ErgP81270 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ErgP81270 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ErgP81270 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ErgP81270 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ErgP81270 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ErgP81270 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ErgP81270 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ErgP81270 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ErgP81270 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ErgP81270 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ErgP81270 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ErgP81270 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ErgP81270 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ErgP81270 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ErgP81270 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ErgP81270 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ErgP81270 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ErgP81270 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ErgP81270 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ErgP81270 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ErgP81270 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ErgP81270 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ErgP81270 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ErgP81270 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ErgP81270 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ErgP81270 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ErgP81270 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ErgP81270 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ErgP81270 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ErgP81270 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ErgP81270 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ErgP81270 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ErgP81270 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ErgP81270 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ErgP81270 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ErgP81270 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ErgP81270 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ErgP81270 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ErgP81270 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ErgP81270 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ErgP81270 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ErgP81270 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ErgP81270 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ErgP81270 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ErgP81270 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ErgP81270 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ErgP81270 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ErgP81270 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ErgP81270 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ErgP81270 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ErgP81270 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ErgP81270 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ErgP81270 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ErgP81270 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ErgP81270 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ErgP81270 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ErgP81270 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ErgP81270 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ErgP81270 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ErgP81270 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ErgP81270 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ErgP81270 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ErgP81270 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ErgP81270 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ErgP81270 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ErgP81270 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ErgP81270 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ErgP81270 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ErgP81270 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ErgP81270 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ErgP81270 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ErgP81270 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ErgP81270 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ErgP81270 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ErgP81270 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms