Protein–RNA interactions for Protein: P81269

Atf1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf1P81269 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf1P81269 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf1P81269 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf1P81269 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf1P81269 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf1P81269 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf1P81269 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf1P81269 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf1P81269 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf1P81269 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf1P81269 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf1P81269 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf1P81269 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf1P81269 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms