Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irx3P81067 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irx3P81067 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irx3P81067 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irx3P81067 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irx3P81067 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx3P81067 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irx3P81067 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irx3P81067 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irx3P81067 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx3P81067 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx3P81067 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx3P81067 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx3P81067 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx3P81067 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms