Protein–RNA interactions for Protein: P70704

Atp8a1, Phospholipid-transporting ATPase IA, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8a1P70704 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atp8a1P70704 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp8a1P70704 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp8a1P70704 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp8a1P70704 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp8a1P70704 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp8a1P70704 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp8a1P70704 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp8a1P70704 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp8a1P70704 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp8a1P70704 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp8a1P70704 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp8a1P70704 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8a1P70704 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8a1P70704 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8a1P70704 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8a1P70704 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8a1P70704 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8a1P70704 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8a1P70704 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8a1P70704 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8a1P70704 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8a1P70704 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8a1P70704 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8a1P70704 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8a1P70704 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8a1P70704 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8a1P70704 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8a1P70704 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8a1P70704 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8a1P70704 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8a1P70704 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8a1P70704 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8a1P70704 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8a1P70704 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8a1P70704 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8a1P70704 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8a1P70704 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8a1P70704 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8a1P70704 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8a1P70704 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8a1P70704 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8a1P70704 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp8a1P70704 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms