Protein–RNA interactions for Protein: P70390

Shox2, Short stature homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shox2P70390 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shox2P70390 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shox2P70390 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shox2P70390 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Shox2P70390 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shox2P70390 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shox2P70390 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shox2P70390 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shox2P70390 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Shox2P70390 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shox2P70390 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shox2P70390 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shox2P70390 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shox2P70390 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shox2P70390 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shox2P70390 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shox2P70390 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shox2P70390 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Shox2P70390 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Shox2P70390 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Shox2P70390 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Shox2P70390 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Shox2P70390 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Shox2P70390 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Shox2P70390 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Shox2P70390 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Shox2P70390 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shox2P70390 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shox2P70390 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shox2P70390 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shox2P70390 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shox2P70390 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Shox2P70390 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shox2P70390 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shox2P70390 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shox2P70390 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shox2P70390 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms