Protein–RNA interactions for Protein: P70348

Gcm1, Chorion-specific transcription factor GCMa, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcm1P70348 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcm1P70348 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcm1P70348 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms