Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smad1P70340 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smad1P70340 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smad1P70340 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smad1P70340 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms