Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gfi1P70338 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gfi1P70338 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gfi1P70338 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gfi1P70338 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gfi1P70338 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gfi1P70338 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gfi1P70338 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gfi1P70338 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gfi1P70338 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gfi1P70338 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gfi1P70338 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gfi1P70338 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gfi1P70338 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gfi1P70338 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gfi1P70338 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gfi1P70338 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gfi1P70338 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gfi1P70338 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms