Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

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Length 946 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pkn1P70268 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkn1P70268 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkn1P70268 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkn1P70268 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkn1P70268 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkn1P70268 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkn1P70268 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkn1P70268 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkn1P70268 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkn1P70268 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkn1P70268 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkn1P70268 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkn1P70268 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkn1P70268 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkn1P70268 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkn1P70268 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkn1P70268 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkn1P70268 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkn1P70268 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkn1P70268 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkn1P70268 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkn1P70268 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkn1P70268 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkn1P70268 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkn1P70268 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkn1P70268 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkn1P70268 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkn1P70268 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkn1P70268 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkn1P70268 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkn1P70268 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkn1P70268 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkn1P70268 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkn1P70268 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkn1P70268 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkn1P70268 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkn1P70268 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkn1P70268 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkn1P70268 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkn1P70268 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms