Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chl1P70232 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chl1P70232 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chl1P70232 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chl1P70232 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chl1P70232 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Chl1P70232 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chl1P70232 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chl1P70232 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chl1P70232 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chl1P70232 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms