Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Traf5P70191 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf5P70191 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf5P70191 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Traf5P70191 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Traf5P70191 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf5P70191 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Traf5P70191 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Traf5P70191 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms