Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkcbP68404 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkcbP68404 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkcbP68404 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkcbP68404 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PrkcbP68404 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkcbP68404 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PrkcbP68404 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PrkcbP68404 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PrkcbP68404 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PrkcbP68404 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkcbP68404 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkcbP68404 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkcbP68404 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkcbP68404 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkcbP68404 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkcbP68404 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkcbP68404 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkcbP68404 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkcbP68404 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkcbP68404 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkcbP68404 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms