Protein–RNA interactions for Protein: P63276

Rps17, 40S ribosomal protein S17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps17P63276 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps17P63276 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps17P63276 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps17P63276 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps17P63276 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps17P63276 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps17P63276 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps17P63276 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps17P63276 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps17P63276 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms