Protein–RNA interactions for Protein: P62965

Crabp1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crabp1P62965 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Crabp1P62965 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crabp1P62965 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms