Protein–RNA interactions for Protein: P62889

Rpl30, 60S ribosomal protein L30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl30P62889 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl30P62889 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl30P62889 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl30P62889 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl30P62889 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl30P62889 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl30P62889 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl30P62889 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl30P62889 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl30P62889 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl30P62889 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl30P62889 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl30P62889 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl30P62889 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl30P62889 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl30P62889 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl30P62889 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl30P62889 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl30P62889 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl30P62889 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl30P62889 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl30P62889 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl30P62889 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl30P62889 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl30P62889 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl30P62889 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl30P62889 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl30P62889 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl30P62889 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl30P62889 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl30P62889 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl30P62889 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms