Protein–RNA interactions for Protein: P62876

Polr2l, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2lP62876 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr2lP62876 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr2lP62876 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr2lP62876 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr2lP62876 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr2lP62876 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr2lP62876 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr2lP62876 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr2lP62876 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr2lP62876 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr2lP62876 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr2lP62876 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr2lP62876 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr2lP62876 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Polr2lP62876 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms