Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms