Protein–RNA interactions for Protein: P62869

Elob, Elongin-B, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElobP62869 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ElobP62869 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ElobP62869 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ElobP62869 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ElobP62869 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ElobP62869 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ElobP62869 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ElobP62869 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ElobP62869 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ElobP62869 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ElobP62869 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ElobP62869 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ElobP62869 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ElobP62869 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ElobP62869 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ElobP62869 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ElobP62869 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ElobP62869 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ElobP62869 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ElobP62869 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ElobP62869 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ElobP62869 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ElobP62869 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ElobP62869 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ElobP62869 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ElobP62869 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ElobP62869 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ElobP62869 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ElobP62869 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ElobP62869 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ElobP62869 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ElobP62869 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ElobP62869 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ElobP62869 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ElobP62869 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ElobP62869 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ElobP62869 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ElobP62869 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ElobP62869 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ElobP62869 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ElobP62869 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ElobP62869 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ElobP62869 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ElobP62869 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ElobP62869 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ElobP62869 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ElobP62869 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ElobP62869 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ElobP62869 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ElobP62869 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ElobP62869 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ElobP62869 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ElobP62869 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ElobP62869 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ElobP62869 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ElobP62869 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ElobP62869 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ElobP62869 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ElobP62869 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ElobP62869 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ElobP62869 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ElobP62869 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ElobP62869 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ElobP62869 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ElobP62869 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ElobP62869 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ElobP62869 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ElobP62869 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ElobP62869 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ElobP62869 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ElobP62869 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ElobP62869 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ElobP62869 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ElobP62869 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ElobP62869 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ElobP62869 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ElobP62869 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ElobP62869 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ElobP62869 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ElobP62869 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ElobP62869 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ElobP62869 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ElobP62869 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ElobP62869 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ElobP62869 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ElobP62869 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ElobP62869 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ElobP62869 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ElobP62869 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ElobP62869 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ElobP62869 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ElobP62869 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ElobP62869 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ElobP62869 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ElobP62869 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ElobP62869 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ElobP62869 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ElobP62869 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ElobP62869 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ElobP62869 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms