Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Snrpd1P62315 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snrpd1P62315 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms