Protein–RNA interactions for Protein: P62301

Rps13, 40S ribosomal protein S13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps13P62301 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps13P62301 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps13P62301 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps13P62301 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps13P62301 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps13P62301 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps13P62301 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps13P62301 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps13P62301 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps13P62301 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps13P62301 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps13P62301 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps13P62301 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps13P62301 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps13P62301 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps13P62301 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps13P62301 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms