Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps11P62281 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps11P62281 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps11P62281 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps11P62281 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps11P62281 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps11P62281 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps11P62281 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps11P62281 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps11P62281 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms