Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lrch1P62046 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrch1P62046 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrch1P62046 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrch1P62046 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrch1P62046 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrch1P62046 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrch1P62046 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrch1P62046 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrch1P62046 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrch1P62046 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrch1P62046 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrch1P62046 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrch1P62046 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrch1P62046 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrch1P62046 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrch1P62046 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrch1P62046 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrch1P62046 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrch1P62046 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrch1P62046 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrch1P62046 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrch1P62046 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrch1P62046 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrch1P62046 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrch1P62046 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Lrch1P62046 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrch1P62046 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrch1P62046 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Lrch1P62046 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrch1P62046 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrch1P62046 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrch1P62046 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrch1P62046 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrch1P62046 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrch1P62046 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrch1P62046 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrch1P62046 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrch1P62046 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrch1P62046 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrch1P62046 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrch1P62046 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrch1P62046 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms