Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme3P61290 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme3P61290 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psme3P61290 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme3P61290 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme3P61290 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme3P61290 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme3P61290 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme3P61290 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme3P61290 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme3P61290 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme3P61290 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme3P61290 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme3P61290 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme3P61290 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme3P61290 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme3P61290 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme3P61290 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme3P61290 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme3P61290 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme3P61290 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psme3P61290 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme3P61290 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme3P61290 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme3P61290 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme3P61290 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme3P61290 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme3P61290 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme3P61290 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme3P61290 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme3P61290 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme3P61290 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme3P61290 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme3P61290 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme3P61290 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psme3P61290 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psme3P61290 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psme3P61290 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psme3P61290 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psme3P61290 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psme3P61290 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psme3P61290 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psme3P61290 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psme3P61290 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psme3P61290 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psme3P61290 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psme3P61290 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psme3P61290 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Psme3P61290 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psme3P61290 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psme3P61290 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psme3P61290 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psme3P61290 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psme3P61290 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psme3P61290 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psme3P61290 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psme3P61290 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms