Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2kP61087 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms