Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rin3P59729 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rin3P59729 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rin3P59729 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rin3P59729 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rin3P59729 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rin3P59729 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rin3P59729 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rin3P59729 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rin3P59729 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rin3P59729 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rin3P59729 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rin3P59729 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rin3P59729 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rin3P59729 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rin3P59729 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rin3P59729 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rin3P59729 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rin3P59729 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rin3P59729 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rin3P59729 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rin3P59729 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rin3P59729 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rin3P59729 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rin3P59729 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rin3P59729 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rin3P59729 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rin3P59729 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rin3P59729 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rin3P59729 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rin3P59729 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rin3P59729 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rin3P59729 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rin3P59729 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms