Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms