Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdrg1P59048 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdrg1P59048 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pdrg1P59048 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pdrg1P59048 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdrg1P59048 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pdrg1P59048 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pdrg1P59048 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pdrg1P59048 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pdrg1P59048 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pdrg1P59048 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pdrg1P59048 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pdrg1P59048 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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