Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vps33bP59016 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vps33bP59016 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vps33bP59016 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vps33bP59016 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vps33bP59016 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vps33bP59016 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vps33bP59016 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Vps33bP59016 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vps33bP59016 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Vps33bP59016 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms