Protein–RNA interactions for Protein: P57791

Rce1, CAAX prenyl protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rce1P57791 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rce1P57791 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rce1P57791 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rce1P57791 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rce1P57791 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rce1P57791 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rce1P57791 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rce1P57791 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rce1P57791 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rce1P57791 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rce1P57791 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rce1P57791 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rce1P57791 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rce1P57791 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rce1P57791 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rce1P57791 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms