Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Samsn1P57725 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms