Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NcstnP57716 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NcstnP57716 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NcstnP57716 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NcstnP57716 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NcstnP57716 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NcstnP57716 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NcstnP57716 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NcstnP57716 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NcstnP57716 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NcstnP57716 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms