Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Cldn18P56857 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Cldn18P56857 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Cldn18P56857 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms