Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bace1P56818 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bace1P56818 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bace1P56818 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bace1P56818 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bace1P56818 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bace1P56818 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bace1P56818 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bace1P56818 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Bace1P56818 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bace1P56818 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bace1P56818 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Bace1P56818 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bace1P56818 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bace1P56818 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms