Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctbp2P56546 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctbp2P56546 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.9 ms