Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp5P56399 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp5P56399 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp5P56399 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp5P56399 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp5P56399 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp5P56399 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp5P56399 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp5P56399 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp5P56399 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp5P56399 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp5P56399 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp5P56399 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp5P56399 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp5P56399 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms