Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sh3bp1P55194 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sh3bp1P55194 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Sh3bp1P55194 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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