Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtskP55097 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtskP55097 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtskP55097 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CtskP55097 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtskP55097 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtskP55097 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtskP55097 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtskP55097 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtskP55097 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtskP55097 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtskP55097 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtskP55097 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtskP55097 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtskP55097 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtskP55097 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtskP55097 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CtskP55097 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtskP55097 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtskP55097 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtskP55097 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtskP55097 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtskP55097 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtskP55097 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtskP55097 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtskP55097 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtskP55097 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtskP55097 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CtskP55097 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtskP55097 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtskP55097 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtskP55097 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtskP55097 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtskP55097 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtskP55097 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CtskP55097 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtskP55097 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtskP55097 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtskP55097 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtskP55097 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtskP55097 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtskP55097 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtskP55097 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtskP55097 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtskP55097 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtskP55097 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtskP55097 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtskP55097 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CtskP55097 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtskP55097 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtskP55097 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtskP55097 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtskP55097 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtskP55097 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtskP55097 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CtskP55097 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CtskP55097 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtskP55097 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtskP55097 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtskP55097 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtskP55097 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtskP55097 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CtskP55097 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtskP55097 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtskP55097 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CtskP55097 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtskP55097 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtskP55097 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtskP55097 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtskP55097 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtskP55097 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtskP55097 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtskP55097 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtskP55097 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtskP55097 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtskP55097 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtskP55097 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtskP55097 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtskP55097 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtskP55097 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtskP55097 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtskP55097 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CtskP55097 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CtskP55097 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CtskP55097 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtskP55097 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtskP55097 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtskP55097 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtskP55097 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtskP55097 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtskP55097 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtskP55097 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CtskP55097 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtskP55097 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtskP55097 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtskP55097 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtskP55097 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtskP55097 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtskP55097 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CtskP55097 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms