Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Aqp4P55088 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Aqp4P55088 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Aqp4P55088 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Aqp4P55088 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Aqp4P55088 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Aqp4P55088 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Aqp4P55088 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Aqp4P55088 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Aqp4P55088 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aqp4P55088 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aqp4P55088 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aqp4P55088 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aqp4P55088 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aqp4P55088 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aqp4P55088 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aqp4P55088 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aqp4P55088 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aqp4P55088 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aqp4P55088 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aqp4P55088 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aqp4P55088 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Aqp4P55088 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aqp4P55088 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aqp4P55088 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Aqp4P55088 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aqp4P55088 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aqp4P55088 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aqp4P55088 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Aqp4P55088 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Aqp4P55088 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Aqp4P55088 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms