Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PctpP53808 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PctpP53808 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PctpP53808 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PctpP53808 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PctpP53808 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PctpP53808 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PctpP53808 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PctpP53808 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PctpP53808 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PctpP53808 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PctpP53808 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PctpP53808 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PctpP53808 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PctpP53808 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PctpP53808 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PctpP53808 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PctpP53808 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PctpP53808 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PctpP53808 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PctpP53808 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PctpP53808 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PctpP53808 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PctpP53808 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PctpP53808 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PctpP53808 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PctpP53808 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PctpP53808 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PctpP53808 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PctpP53808 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PctpP53808 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PctpP53808 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
PctpP53808 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PctpP53808 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PctpP53808 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PctpP53808 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PctpP53808 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PctpP53808 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PctpP53808 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PctpP53808 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PctpP53808 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PctpP53808 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PctpP53808 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PctpP53808 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PctpP53808 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PctpP53808 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PctpP53808 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PctpP53808 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PctpP53808 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PctpP53808 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PctpP53808 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PctpP53808 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PctpP53808 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PctpP53808 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PctpP53808 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PctpP53808 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PctpP53808 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PctpP53808 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PctpP53808 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PctpP53808 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PctpP53808 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PctpP53808 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PctpP53808 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PctpP53808 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PctpP53808 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PctpP53808 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PctpP53808 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PctpP53808 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PctpP53808 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PctpP53808 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PctpP53808 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PctpP53808 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PctpP53808 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PctpP53808 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PctpP53808 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PctpP53808 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PctpP53808 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PctpP53808 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PctpP53808 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PctpP53808 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PctpP53808 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PctpP53808 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PctpP53808 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PctpP53808 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PctpP53808 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PctpP53808 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PctpP53808 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PctpP53808 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PctpP53808 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PctpP53808 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PctpP53808 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PctpP53808 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PctpP53808 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PctpP53808 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PctpP53808 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PctpP53808 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PctpP53808 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PctpP53808 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PctpP53808 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PctpP53808 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms